More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3005 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
370 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  94.57 
 
 
370 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  89.43 
 
 
371 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  76.86 
 
 
376 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  75 
 
 
374 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  74.72 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  76.03 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  73.9 
 
 
374 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  65.32 
 
 
374 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  65.05 
 
 
374 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  63.11 
 
 
365 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  54.96 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  56.2 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  55.4 
 
 
374 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  58.38 
 
 
384 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 
369 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 
362 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  49.03 
 
 
369 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
370 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  54.04 
 
 
369 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 
373 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  52.79 
 
 
370 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 
369 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  53.61 
 
 
370 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  51.37 
 
 
385 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  49.45 
 
 
371 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  51.34 
 
 
379 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  45.78 
 
 
367 aa  328  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  49.6 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  47.01 
 
 
380 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  48.91 
 
 
381 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  44.88 
 
 
362 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  46.99 
 
 
373 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  46.09 
 
 
372 aa  311  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  45.65 
 
 
380 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
386 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
365 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
365 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  43.3 
 
 
358 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.47 
 
 
370 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  47.59 
 
 
365 aa  292  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 
388 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  48.63 
 
 
373 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  43.56 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  41.14 
 
 
374 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 
364 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  43.75 
 
 
362 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  41.41 
 
 
383 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
370 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 
373 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
375 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  41.34 
 
 
365 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
370 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
370 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
363 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  43.88 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
368 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
365 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 
377 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
368 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  40.66 
 
 
359 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
365 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
369 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
373 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
389 aa  238  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  36.74 
 
 
369 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  37.96 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  36.9 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
365 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  39.52 
 
 
362 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
369 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 
370 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
365 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
387 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 
371 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  44.34 
 
 
360 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  42.12 
 
 
352 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
371 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
392 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  39.33 
 
 
386 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  40.38 
 
 
367 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
373 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  36.99 
 
 
375 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  42.78 
 
 
359 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
368 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
366 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>