72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3924 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3924  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3925  hypothetical protein  42.56 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  30.36 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0843  glycosyl transferase family 9  34.75 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0221894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  36.04 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  34.31 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  30.63 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  33.66 
 
 		 358 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.79 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  25.43 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.26 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 403 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  24.47 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  32.11 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  35.4 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  35.4 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  30.39 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  35 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  30.39 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  35.4 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  35.4 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  35.4 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  35.4 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  35.4 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  29.75 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  30.65 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  33.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.25 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  29.75 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 402 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.43 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5532  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  28.69 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.78 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  29.29 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  33.03 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.33 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  28.43 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  30.36 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  31 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  28.32 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  32.11 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  31.07 
 
 		 410 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1807  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  35.9 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>