273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3503 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6351  TrkA domain-containing protein  49.42 
 
 
266 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.514037  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.87 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.41 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.51 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.94 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.17 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.8 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.17 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.33 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30.74 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  30.86 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.46 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 
330 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.8 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.87 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.87 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 
356 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.93 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.75 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.73 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.42 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.39 
 
 
366 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.58 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.79 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  24.17 
 
 
371 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
364 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
364 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
364 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 
362 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  23.81 
 
 
332 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 
335 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
364 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.84 
 
 
335 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.54 
 
 
364 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
364 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 
654 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  30.65 
 
 
583 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.94 
 
 
368 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.54 
 
 
386 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.2 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 
350 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 
350 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 
657 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.17 
 
 
655 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  23.68 
 
 
352 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 
341 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  27.37 
 
 
561 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.4 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.39 
 
 
346 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.16 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 
531 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  23.5 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.33 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  29.41 
 
 
556 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.14 
 
 
648 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.12 
 
 
346 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  22.16 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  31.67 
 
 
631 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  22.16 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  28.29 
 
 
561 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  22.16 
 
 
351 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  27.12 
 
 
346 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  30.36 
 
 
601 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  26 
 
 
369 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 
413 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  26 
 
 
369 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  26 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  31.88 
 
 
567 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  26 
 
 
369 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.81 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  30.36 
 
 
601 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  33.87 
 
 
574 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 
570 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
653 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  31.4 
 
 
646 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  31.9 
 
 
646 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  32.03 
 
 
568 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.98 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  26.4 
 
 
355 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 
583 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  31.9 
 
 
632 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>