More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2445 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2445  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 		 417 aa  850    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.839572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.5 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  34.2 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.67 
 
 		 449 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.01 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  33.1 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  33.57 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  33.18 
 
 		 450 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  33.57 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  33.57 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  33.18 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  33.18 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  34.03 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.26 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  32.94 
 
 		 450 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  30.41 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  33.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  33.18 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  32.62 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  35.23 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.73 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  32.39 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.16 
 
 		 434 aa  222  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  31.33 
 
 		 436 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.66 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.42 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.86 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.38 
 
 		 429 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.65 
 
 		 430 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.14 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.74 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.19 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.51 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.42 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.57 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.6 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10340  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.51 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0729922  unclonable  0.00000000167703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.56 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.09 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  28.24 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.16 
 
 		 438 aa  209  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.72 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.79 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.72 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  32.42 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.26 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  29.04 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.04 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.25 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  32.01 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.03 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  30.59 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  30.32 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  32.24 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1886  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.45 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000824769  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  29.28 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.47 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  32.69 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1645  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.89 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447021  hitchhiker  0.00298865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.66 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.75 
 
 		 471 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.21 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.78 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.6 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  31.5 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  31.99 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1810  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.22 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.95 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.65 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1352  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.65 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  29.64 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  30.12 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  31.23 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  29.38 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0860  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.65 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.1 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.23 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  31.46 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  30.1 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.58 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.19 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.19 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.43 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  32.74 
 
 		 478 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.61 
 
 		 523 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.74 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.42 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.74 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.52 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.36 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.64 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.76 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.53 
 
 		 438 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.59 
 
 		 531 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  26.71 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>