More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0001 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
459 aa  939    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.98 
 
 
449 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
453 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
453 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 
446 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 
457 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  32.29 
 
 
451 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  39.35 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.64 
 
 
450 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 
457 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  38.35 
 
 
450 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
443 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.49 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  33.11 
 
 
468 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.11 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  32.76 
 
 
469 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 
468 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 
474 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.47 
 
 
454 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  33.88 
 
 
461 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  33.49 
 
 
461 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  33.89 
 
 
460 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.65 
 
 
462 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  33.65 
 
 
462 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  33.65 
 
 
462 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  33.65 
 
 
462 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.57 
 
 
460 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  34.36 
 
 
460 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  33.65 
 
 
462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
468 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.32 
 
 
465 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  33.03 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  33.49 
 
 
457 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  34.72 
 
 
462 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.31 
 
 
442 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.13 
 
 
463 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  28.84 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  33.1 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  38.71 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  34.2 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.07 
 
 
516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 
465 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  39 
 
 
443 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.87 
 
 
491 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.88 
 
 
452 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000136146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.14 
 
 
443 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.53 
 
 
461 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  35.63 
 
 
524 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  36.52 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.25 
 
 
462 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.54 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  37.43 
 
 
533 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  36.72 
 
 
529 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.82 
 
 
444 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.82 
 
 
584 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.02 
 
 
483 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.13 
 
 
436 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.59 
 
 
464 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  36.46 
 
 
529 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 
465 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931933  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.08 
 
 
447 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
579 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  29.53 
 
 
472 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.43 
 
 
462 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
466 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  30.75 
 
 
462 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
466 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
466 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
466 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  30.75 
 
 
462 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
466 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  32.11 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  37.54 
 
 
522 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  31.55 
 
 
463 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.57 
 
 
467 aa  236  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  236  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  31.93 
 
 
468 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  38.26 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>