36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2577 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  963    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  54.15 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  38.67 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  38.26 
 
 		 455 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  40.27 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  38.38 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  38.55 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  36.89 
 
 		 456 aa  309  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  36.89 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  36.28 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  32.46 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  33.7 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.65 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  33.26 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  27 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  25.43 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  29.65 
 
 		 616 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  27.32 
 
 		 596 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  27.72 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  28.18 
 
 		 571 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  28.09 
 
 		 608 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  25.58 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  25.27 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  30.05 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  25.42 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  28.21 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  22.88 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  28.57 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  28.25 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  23.79 
 
 		 590 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  27.45 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  25.42 
 
 		 598 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  26.11 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  27.57 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  23.38 
 
 		 590 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  22.65 
 
 		 627 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>