82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27100  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54920  predicted protein  34.43 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849074  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_93538  predicted protein  27.05 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0108405  normal  0.381062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.79 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  32.63 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0318  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  24.69 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  38 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.41 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.26 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.41 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.41 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  29.08 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  35.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.99 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  25.99 
 
 		 204 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 222 aa  42  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 		 249 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.07 
 
 		 203 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  24.69 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 258 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.48 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 234 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>