176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  100 
 
 
396 aa  781    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  59.49 
 
 
321 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  59.31 
 
 
320 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.05 
 
 
317 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.76 
 
 
325 aa  328  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  53.35 
 
 
330 aa  318  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.65 
 
 
328 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.68 
 
 
358 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.88 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  53.31 
 
 
317 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  52.88 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  52.2 
 
 
337 aa  299  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.7 
 
 
330 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.3 
 
 
311 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.02 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.84 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.21 
 
 
428 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  46.88 
 
 
346 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  49.85 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  50.95 
 
 
360 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.2 
 
 
333 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.25 
 
 
320 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  45.25 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.25 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.25 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.96 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  43.2 
 
 
342 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  45.66 
 
 
323 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.69 
 
 
368 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.54 
 
 
326 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.62 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.28 
 
 
344 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.25 
 
 
339 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  45.72 
 
 
308 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.08 
 
 
366 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.82 
 
 
337 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.52 
 
 
463 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  40.66 
 
 
316 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.83 
 
 
317 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.69 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.69 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.76 
 
 
323 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  30.95 
 
 
421 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  38.46 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  36.54 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.67 
 
 
339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.52 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  38.11 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.11 
 
 
317 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.4 
 
 
358 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.18 
 
 
388 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.36 
 
 
438 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  36.12 
 
 
331 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  36.12 
 
 
331 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.02 
 
 
437 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  36.29 
 
 
324 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.74 
 
 
453 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  36.36 
 
 
458 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.84 
 
 
428 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  31.8 
 
 
439 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  34.81 
 
 
341 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.87 
 
 
457 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.45 
 
 
330 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  35.35 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  36.95 
 
 
324 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  31.85 
 
 
448 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.22 
 
 
325 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.86 
 
 
324 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  39.16 
 
 
446 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.85 
 
 
375 aa  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.11 
 
 
324 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.51 
 
 
439 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.08 
 
 
314 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  33.58 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.69 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.69 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  37.83 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  33.97 
 
 
327 aa  146  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  34.63 
 
 
461 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  32.62 
 
 
461 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  35.06 
 
 
461 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  37.39 
 
 
451 aa  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  34.35 
 
 
461 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.86 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  35.15 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  32.14 
 
 
365 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.27 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  31.95 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  36.52 
 
 
502 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  36.09 
 
 
465 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  39.83 
 
 
321 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  36.09 
 
 
465 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>