More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  969    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 469 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 471 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 467 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 488 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 487 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 480 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  49.69 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.4 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 470 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 461 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 459 aa  355  8.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 494 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 456 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 465 aa  346  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 461 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 505 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 451 aa  340  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>