More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3235 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3235  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  97.3 
 
 
222 aa  431  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  97.3 
 
 
222 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  53.95 
 
 
502 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  53.49 
 
 
502 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.71 
 
 
223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1919  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  48.42 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375316  hitchhiker  0.00379946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.62 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0173  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.25 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0340147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0218  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.79 
 
 
223 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2510  amino acid ABC transporter, permease protein  48.87 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000045662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002011  amino acid ABC transporter permease protein  47.3 
 
 
223 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0007  putative amino-acid ABC transporter, permease protein  48.2 
 
 
223 aa  205  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000426634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0110  ABC-type amino acid transport system, permease component  45.25 
 
 
222 aa  205  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00440  ABC amino acid transporter permease component  47.3 
 
 
223 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2601  amino acid ABC transporter permease  42.01 
 
 
243 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
222 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.86 
 
 
222 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
222 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  43.33 
 
 
221 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.27 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  43.33 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0357  amino acid ABC transporter permease  43.33 
 
 
222 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.56 
 
 
213 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3039  amino acid ABC transporter permease  42.11 
 
 
216 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  40.85 
 
 
220 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 
220 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1618  ABC-type amino acid transport system, permease component  36.89 
 
 
307 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000682823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  38.91 
 
 
222 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  43.19 
 
 
222 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  38.53 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  38.91 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  38.91 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  41.43 
 
 
230 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
239 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 
230 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
230 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  35.91 
 
 
222 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1291  His/Glu/Gln/Arg/opine family amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 
222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2375  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
220 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2273  amino acid ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 
220 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
239 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2438  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
239 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  38.07 
 
 
219 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
222 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
222 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
222 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
222 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
222 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
222 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
222 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  38.6 
 
 
223 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
274 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
513 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.43 
 
 
230 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
222 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2008  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
222 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0198583  decreased coverage  0.00681365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04080  putative permease of ABC transporter  41.43 
 
 
230 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 
232 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  38.73 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  38.73 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  38.24 
 
 
226 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  38.24 
 
 
232 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 
209 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.19 
 
 
219 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
245 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
234 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
232 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
222 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  37.56 
 
 
223 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  38.01 
 
 
223 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.58 
 
 
217 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.7 
 
 
503 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
225 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
243 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1552  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
230 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0291  amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
267 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
234 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>