55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0413 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  89.86 
 
 		 217 aa  407  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  89.4 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  89.86 
 
 		 217 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  89.4 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  90.32 
 
 		 217 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  90.32 
 
 		 217 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  90.32 
 
 		 217 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  90.32 
 
 		 217 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  88.48 
 
 		 217 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  74.54 
 
 		 217 aa  339  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  46.28 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2192  transcriptional regulator, XRE family  40.8 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.426149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1805  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  38.89 
 
 		 120 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  48.78 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  29.76 
 
 		 139 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 130 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  29.29 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  31.65 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  34.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  41.79 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  34.04 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  38.81 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  38.81 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 80 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 489 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 490 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  32.73 
 
 		 401 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  40.3 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  29.87 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  36.49 
 
 		 125 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  31.17 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  29.87 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  41.3 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  30.95 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 503 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  31.25 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>