57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6580 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  344  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  79.65 
 
 
175 aa  270  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  51.16 
 
 
182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  56.67 
 
 
170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  46.58 
 
 
181 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  47.68 
 
 
179 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  45.61 
 
 
184 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  43.64 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  41.04 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  42.76 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  42.07 
 
 
172 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  40.46 
 
 
237 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  39.87 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  42.47 
 
 
195 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  45.77 
 
 
205 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  33.79 
 
 
186 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  35.37 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  41.18 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  87.8  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  38.51 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  30.64 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  28.93 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  28.74 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  26.79 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  23.76 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  27.5 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  26.79 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  26.9 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  26.19 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  27.66 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  27.4 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  24.67 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  33.57 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  25.52 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  27.7 
 
 
188 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  46.97 
 
 
210 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  27.34 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  25.44 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  28.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  46.77 
 
 
210 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  27.86 
 
 
182 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  26.78 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  45.45 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  34.51 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  27.43 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  27.27 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  26.9 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  31.82 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  32.35 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  31.08 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  31.51 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  31.51 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  28.19 
 
 
191 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  25.33 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>