More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2494 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  85.26 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  85.34 
 
 		 192 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  85.34 
 
 		 192 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  83.68 
 
 		 193 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  85.26 
 
 		 191 aa  322  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  82.2 
 
 		 192 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  81.68 
 
 		 222 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  70.68 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  68.62 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  69.15 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  69.15 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  69.15 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  68.25 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  66.14 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  66.14 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  61.17 
 
 		 196 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  61.17 
 
 		 196 aa  247  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  61.17 
 
 		 196 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  61.17 
 
 		 196 aa  247  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  60.64 
 
 		 196 aa  246  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  60.64 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  60.64 
 
 		 196 aa  245  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  60.64 
 
 		 196 aa  245  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  60.64 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  62.83 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  52.15 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  53.01 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  52.78 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  52.78 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  51.97 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  44.04 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  43.32 
 
 		 202 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  50.33 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  40.64 
 
 		 318 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  41.94 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  40.54 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.97 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.97 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.97 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.62 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.36 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.46 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.5 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.71 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.71 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.71 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  38.71 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.8 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.69 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.86 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  40 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37.63 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.83 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  40 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 231 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  41.4 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.1 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.88 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.46 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.12 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.81 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  37.63 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  33.14 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.38 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  32.8 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.41 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  39.04 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.3 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>