53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1378 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  90.34 
 
 		 514 aa  925    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1044    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  71.56 
 
 		 480 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  85.46 
 
 		 492 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  98.05 
 
 		 512 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  90.32 
 
 		 514 aa  930    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  70.57 
 
 		 509 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  98.05 
 
 		 512 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  69.21 
 
 		 502 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  71.84 
 
 		 487 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  68.25 
 
 		 529 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  68.25 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  65.86 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  66.44 
 
 		 491 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  68.48 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  66.06 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  65.83 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  66.06 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  57.83 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  58.51 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  58.45 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  34.18 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.18 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  36.24 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  34.5 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  33.18 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  33.42 
 
 		 455 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  29.7 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  31.93 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  29.76 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  28.89 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  29.27 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  26.28 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.15 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  26.33 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  30.64 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  25.67 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  24.45 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  33.99 
 
 		 187 aa  67  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  25.2 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  25.2 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  24.15 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  25.32 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  24.1 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  24.38 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  23.85 
 
 		 508 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  24.41 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1712  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  27.21 
 
 		 201 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  40.98 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  21.51 
 
 		 511 aa  43.5  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>