39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1287 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  50 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  38.71 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  41.67 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  40 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  34.57 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  34.69 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  39.39 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 100 aa  43.5  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  33.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  25.29 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  47.37 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  45.71 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 253 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3476  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 342 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  48.98 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.1 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  40.62 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>