63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0892 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0892    100 
 
 		 2308 bp  4575    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  96.68 
 
 		 753 bp  985    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4205    99.53 
 
 		 2288 bp  2876    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    99.73 
 
 		 2279 bp  2886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  99.67 
 
 		 606 bp  1174    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4467    99.37 
 
 		 2251 bp  3358    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  99.13 
 
 		 852 bp  1096    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  83.96 
 
 		 852 bp  323  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  83.96 
 
 		 852 bp  323  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1788    96.35 
 
 		 138 bp  232  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.363185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  84.23 
 
 		 501 bp  204  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  93.48 
 
 		 891 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  92 
 
 		 834 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 825 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  93.48 
 
 		 891 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  93.48 
 
 		 891 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  93.48 
 
 		 891 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  90.57 
 
 		 813 bp  65.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  90.57 
 
 		 810 bp  65.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00574  transposase and inactivated derivatives  88.14 
 
 		 672 bp  61.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01088  transposase and inactivated derivatives  88.14 
 
 		 558 bp  61.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02274  transposase and inactivated derivatives  88.14 
 
 		 672 bp  61.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06226  transposase and inactivated derivatives  88.14 
 
 		 558 bp  61.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0359    88.14 
 
 		 804 bp  61.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    90 
 
 		 3753 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  90 
 
 		 813 bp  60  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1411    86.89 
 
 		 906 bp  58  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 		 543 bp  58  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 891 bp  56  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 891 bp  56  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  88.46 
 
 		 810 bp  56  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 870 bp  56  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  89.58 
 
 		 792 bp  56  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 870 bp  56  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 870 bp  56  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 696 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  89.13 
 
 		 852 bp  52  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  85.96 
 
 		 816 bp  50.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  88.89 
 
 		 891 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>