More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3452 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 359 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  44.97 
 
 		 346 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  42.57 
 
 		 345 aa  242  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  44.7 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  44.02 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.05 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  50.7 
 
 		 253 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.34 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.03 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.09 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.36 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  32.83 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  31.37 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.62 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  34.46 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.69 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3700  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696494  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  27.5 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.18 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.73 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  28.65 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.92 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  25.15 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.12 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  25.88 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  25.88 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  26.38 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  28.28 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.02 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  27.82 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>