More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2752 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  82.42 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  80.22 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  76.92 
 
 		 93 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  63.74 
 
 		 93 aa  124  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  63.74 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  61.36 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  105  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  54.44 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  53.76 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  63.74 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  41.94 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  40.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  48.35 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  47.19 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  45.05 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  47.19 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  44.94 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  47.19 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  44.94 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  46.07 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  43.96 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  49.45 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  44.94 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  44.94 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>