More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1768 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  98.8 
 
 		 166 aa  320  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 166 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  93.37 
 
 		 166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  93.37 
 
 		 166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 179 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  92.17 
 
 		 166 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  80 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  86.71 
 
 		 166 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  68.03 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.48 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  36.22 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  39.06 
 
 		 259 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  31.85 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  37.3 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  49.21 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  48.57 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.73 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  33.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.68 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  34.65 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  44.29 
 
 		 125 aa  62  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 124 aa  62  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 274 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 341 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  47.3 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  37.38 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>