26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6788 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 		 455 aa  926    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  57.24 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  57.24 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  58.11 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  51.09 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  51.71 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  50 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  43.81 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  44.94 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.7 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.26 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.17 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.56 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.73 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.07 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  23.4 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.79 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.65 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  30.51 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.73 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  36 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>