118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6598 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6598  transposase IS66 family  100 
 
 		 48 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  91.3 
 
 		 517 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  86.05 
 
 		 540 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  86.05 
 
 		 540 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  86.05 
 
 		 540 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  79.07 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  76.74 
 
 		 507 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  76.74 
 
 		 507 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  76.74 
 
 		 506 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  76.74 
 
 		 519 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  76.74 
 
 		 517 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  76.74 
 
 		 519 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  72.09 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  72.09 
 
 		 511 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  72.09 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  72.09 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  72.09 
 
 		 511 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  76.19 
 
 		 504 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  76.19 
 
 		 504 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  76.19 
 
 		 504 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  73.17 
 
 		 511 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  73.17 
 
 		 511 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  72.09 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  71.11 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4638  transposase IS66  71.11 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4702  transposase IS66  71.11 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0921024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  70.73 
 
 		 511 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  70.73 
 
 		 511 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  67.44 
 
 		 523 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  63.64 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6390  transposase IS66 family  72.09 
 
 		 48 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  65.12 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  65.12 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  65.12 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  65.12 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0026  transposase IS66  57.14 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2538  transposase IS66  57.14 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  57.14 
 
 		 515 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  48.94 
 
 		 542 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  68.57 
 
 		 36 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  47.83 
 
 		 545 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  47.83 
 
 		 545 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  47.83 
 
 		 545 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  47.83 
 
 		 545 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  47.83 
 
 		 540 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  48.89 
 
 		 540 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  50 
 
 		 562 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  50 
 
 		 549 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0369  hypothetical protein  59.46 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.902852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  56.41 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  59.46 
 
 		 491 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  56.1 
 
 		 535 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  57.5 
 
 		 556 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  46.34 
 
 		 527 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  46.34 
 
 		 527 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4451  hypothetical protein  57.89 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601744  normal  0.0168193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  46.34 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  46.34 
 
 		 404 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  46.34 
 
 		 545 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  46.34 
 
 		 545 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  51.35 
 
 		 531 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  54.55 
 
 		 530 aa  44.3  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  48.84 
 
 		 551 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  46.34 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  46.34 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  46.34 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  46.34 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  56.25 
 
 		 516 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  53.66 
 
 		 694 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  56.76 
 
 		 520 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  55.26 
 
 		 553 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  55.26 
 
 		 553 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  43.18 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  51.35 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  51.35 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  51.35 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  51.35 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  48.65 
 
 		 532 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  51.22 
 
 		 530 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  46.81 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  52.63 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  54.05 
 
 		 524 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0400  transposase and inactivated derivative  47.62 
 
 		 57 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.215099  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3041  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  41.86 
 
 		 522 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>