51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4451 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4451  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601744  normal  0.0168193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  66.67 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  63.27 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  62.5 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  62.5 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  62.5 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  60.42 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  60.42 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  60.42 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  58.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  58.33 
 
 		 540 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  58.33 
 
 		 540 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  58.33 
 
 		 540 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  58.33 
 
 		 506 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  58.33 
 
 		 507 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  58.33 
 
 		 507 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  53.06 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  56.25 
 
 		 511 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4702  transposase IS66  55.56 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0921024 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4638  transposase IS66  55.56 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  48.98 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  52.08 
 
 		 523 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  58.33 
 
 		 517 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  55.56 
 
 		 528 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6390  transposase IS66 family  55.26 
 
 		 48 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  57.5 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  57.5 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  57.5 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  57.5 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6598  transposase IS66 family  57.89 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  48.94 
 
 		 535 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  42.22 
 
 		 491 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  60 
 
 		 36 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  40 
 
 		 545 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>