More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0068 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  100 
 
 		 68 aa  140  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  64.52 
 
 		 504 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  64.52 
 
 		 504 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  64.52 
 
 		 504 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  62.9 
 
 		 519 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  62.9 
 
 		 519 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  62.9 
 
 		 517 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  62.9 
 
 		 506 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  62.9 
 
 		 507 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  62.9 
 
 		 507 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  64.52 
 
 		 509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  62.9 
 
 		 523 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  63.93 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  62.3 
 
 		 511 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  63.93 
 
 		 540 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  63.93 
 
 		 540 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  63.93 
 
 		 540 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  60.66 
 
 		 511 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  61.67 
 
 		 511 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  61.76 
 
 		 205 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  58.82 
 
 		 521 aa  84.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  63.93 
 
 		 517 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  60.66 
 
 		 70 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  60.66 
 
 		 528 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  54.84 
 
 		 545 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  54.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4638  transposase IS66  60 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4702  transposase IS66  60 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0921024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  54.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  54.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  54.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  54.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  59.02 
 
 		 579 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  59.02 
 
 		 579 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  59.02 
 
 		 579 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  59.02 
 
 		 579 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  53.23 
 
 		 527 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  53.23 
 
 		 521 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  53.23 
 
 		 527 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  53.23 
 
 		 522 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  56.45 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  53.23 
 
 		 540 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  56.45 
 
 		 556 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  51.61 
 
 		 549 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  57.38 
 
 		 524 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  52.38 
 
 		 535 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  56.45 
 
 		 537 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  57.38 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  54.1 
 
 		 491 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  50 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  48.39 
 
 		 552 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  48.39 
 
 		 552 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  48.39 
 
 		 552 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  53.33 
 
 		 553 aa  68.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  51.61 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  52.38 
 
 		 538 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4919  hypothetical protein  49.21 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.759352 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  50.79 
 
 		 549 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  50.82 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  51.61 
 
 		 551 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1608  transposase family  50 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.61911e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  50.82 
 
 		 533 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  51.61 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  54.1 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  47.62 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  47.62 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  48.39 
 
 		 531 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  46.77 
 
 		 404 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  46.77 
 
 		 337 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  50.82 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  47.62 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  47.62 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  52.46 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  46.88 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  49.18 
 
 		 522 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  49.18 
 
 		 524 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  49.18 
 
 		 520 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>