More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0284 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  83.33 
 
 		 511 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  83.33 
 
 		 511 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  83.33 
 
 		 511 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  83.33 
 
 		 511 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  83.33 
 
 		 511 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  84.38 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  84.38 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  81.25 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  75.38 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  75.38 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  75.38 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  79.69 
 
 		 511 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  72.31 
 
 		 506 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  72.31 
 
 		 507 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  72.31 
 
 		 507 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  71.64 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  73.44 
 
 		 504 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  72.31 
 
 		 509 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  73.44 
 
 		 504 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  73.44 
 
 		 504 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  68.18 
 
 		 540 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  68.18 
 
 		 540 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  68.18 
 
 		 540 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  67.69 
 
 		 523 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  65.67 
 
 		 517 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  62.12 
 
 		 528 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  65.22 
 
 		 579 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  65.22 
 
 		 579 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  65.22 
 
 		 579 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  65.22 
 
 		 579 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4702  transposase IS66  62.5 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0921024 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4638  transposase IS66  62.5 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  60.66 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  56.25 
 
 		 535 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  50.77 
 
 		 549 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  48.48 
 
 		 562 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  48.44 
 
 		 527 aa  70.5  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  48.44 
 
 		 527 aa  70.5  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  46.15 
 
 		 521 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  46.15 
 
 		 522 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  48.48 
 
 		 540 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4919  hypothetical protein  49.28 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.759352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  52.38 
 
 		 556 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  46.15 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  54.24 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  55.93 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  42.42 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  43.94 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  43.94 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  43.94 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  43.94 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  48.48 
 
 		 551 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2538  transposase IS66  46.15 
 
 		 487 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0026  transposase IS66  46.15 
 
 		 487 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  42.42 
 
 		 540 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  51.61 
 
 		 491 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  46.88 
 
 		 545 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  46.88 
 
 		 545 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  46.88 
 
 		 545 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  45.31 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  46.88 
 
 		 545 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  46.88 
 
 		 545 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  46.88 
 
 		 545 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  50 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6598  transposase IS66 family  63.64 
 
 		 48 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  48.44 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  47.69 
 
 		 549 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  46.03 
 
 		 530 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  46.03 
 
 		 530 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4451  hypothetical protein  53.06 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601744  normal  0.0168193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  47.46 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  46.15 
 
 		 538 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  50 
 
 		 508 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  50.85 
 
 		 553 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  47.46 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  47.62 
 
 		 537 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  49.18 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  46.67 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  49.18 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  50 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  42.19 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  42.19 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  43.94 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  43.94 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  43.94 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  50 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  46.67 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  47.69 
 
 		 516 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>