More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5213 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  87.34 
 
 		 403 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  89.08 
 
 		 403 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  90.82 
 
 		 403 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 403 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  89.08 
 
 		 403 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  96.53 
 
 		 403 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  89.08 
 
 		 403 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  82.63 
 
 		 391 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  78.66 
 
 		 423 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  82.11 
 
 		 391 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  79.51 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  77.17 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  80.53 
 
 		 384 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  80.53 
 
 		 384 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  68.81 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  68.95 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  57.53 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  56.99 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.26 
 
 		 409 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  53.46 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  44.17 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.41 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  44.17 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.47 
 
 		 395 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.82 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  42.33 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.49 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.31 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.4 
 
 		 395 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.22 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  39.8 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.2 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.95 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  37.53 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  40.11 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.43 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.48 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.24 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.85 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  39.85 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.06 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  35.51 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.33 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.76 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.83 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.57 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.57 
 
 		 451 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  36.78 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  36.78 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  34.46 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.1 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  31.58 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.33 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.33 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.08 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  35.57 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.88 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  35.57 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.34 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.49 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  33.67 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.22 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.09 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.79 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  34.33 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.82 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.09 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.08 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  30.93 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.26 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  33.5 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  34.1 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.77 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  33.25 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.65 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.28 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.18 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.08 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  36.48 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.19 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.17 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.41 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.21 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  32.88 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.83 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.42 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>