More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5131 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  97.67 
 
 		 343 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  84.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  84.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  84.75 
 
 		 343 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  84.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  84.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  84.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  84.16 
 
 		 343 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  56.64 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  53.8 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.8 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  53.8 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  55.43 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  53.8 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  53.51 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  53.51 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  54.55 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.96 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.96 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  53.67 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  53.08 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  52.05 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  52.05 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  52.05 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  52.05 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  54.33 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  45.16 
 
 		 340 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.63 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.12 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.25 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.84 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.84 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.11 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.52 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.08 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  31.76 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.27 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.06 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.26 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  32.02 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  31.76 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.91 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.42 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.81 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.81 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.81 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.81 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.81 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  30.81 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.81 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.21 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.81 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  31.64 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  31.64 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.7 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.84 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  32.37 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  31.67 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  32.02 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  31.18 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  30.95 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.44 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.53 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  32.74 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  32.64 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  29.94 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  31.85 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  30.65 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  30.03 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>