More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4869 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  96.15 
 
 		 286 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  86.17 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  86.17 
 
 		 286 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  86.17 
 
 		 286 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  82.08 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  85.21 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  63.7 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  64.81 
 
 		 275 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  67.05 
 
 		 286 aa  324  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  68.15 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  65.33 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.9 
 
 		 276 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  62.27 
 
 		 276 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  61.9 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  62.27 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  58.21 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  59.71 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  58.39 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  63.75 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  56.82 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  63.35 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  57.25 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  55.02 
 
 		 275 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  56.65 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  55.3 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  53.03 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  52.19 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  52.47 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  51.71 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.17 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.43 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  57.09 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  51.33 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  55.98 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  48.47 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  50.91 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  47.47 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  51.69 
 
 		 275 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  53.68 
 
 		 274 aa  215  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  49.43 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  56.28 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  52.4 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  53.82 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  48.48 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  48.31 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  38.15 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.55 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  42.01 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.39 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  38.04 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.39 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.2 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.6 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  41.39 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  39.57 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.9 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  32.3 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  27.47 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.8 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.04 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32.46 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.99 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  35.27 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.08 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  32.64 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  33.61 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  33.77 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  36.67 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  35.02 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  32.78 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  32.78 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  31.12 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  32.52 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  35.15 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  38.21 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.33 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  37.96 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.61 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  36 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.78 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  36 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  36 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  38.4 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  37.05 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  34.91 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  36.65 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  34.67 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  33.61 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  33.93 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  37.93 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  38.7 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  40.65 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.01 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.2 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>