145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3354 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  95.69 
 
 		 116 aa  226  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  86.09 
 
 		 114 aa  199  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  86.09 
 
 		 114 aa  199  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  86.09 
 
 		 114 aa  199  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  83.48 
 
 		 115 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  72.81 
 
 		 115 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  67.54 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  69.49 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  69.49 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  67.77 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  71.05 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  61.4 
 
 		 111 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  65.79 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  73.53 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  73.53 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  45.13 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  49.6 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  46.02 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  45.22 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  45.22 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  59.26 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  62.32 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  48.45 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  47.96 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  54.65 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  55 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  56.41 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  48.91 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  45.19 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  57.14 
 
 		 272 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  57.97 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  59.42 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  44.23 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  59.7 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  57.97 
 
 		 94 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  59.7 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  49.49 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  53.52 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  52.11 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  56.25 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  54.05 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  53.62 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5286  putative signal peptide protein  43.12 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.903888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1645  conserved hypothetical signal peptide protein  43.12 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  52.31 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  38.95 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  38.95 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  47.76 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  34.78 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  34.78 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  38.68 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  45.83 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  48.57 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  48.57 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  46.27 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  48.57 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  48.57 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  48.57 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  48.57 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  48.57 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  46.38 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  50 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  49.23 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  42.31 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  43.96 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  38.55 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  39.29 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  50 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  43.24 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  41.89 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  41.9 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  49.28 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  41.33 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  49.3 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  38.67 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  45.31 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  56.6 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  31.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  56.6 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  37.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  49.06 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 486 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  30.36 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  39.78 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  34.07 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  34.07 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  34.85 
 
 		 546 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0168  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>