73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0189 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  99.7 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  97.61 
 
 
335 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  97.61 
 
 
335 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  98.79 
 
 
331 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  99.7 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  100 
 
 
331 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  99.7 
 
 
331 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  99.4 
 
 
331 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  99.7 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  99.7 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  91.59 
 
 
321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  91.59 
 
 
321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  63.5 
 
 
312 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  64.52 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  64.52 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  64.54 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  64.84 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  63.87 
 
 
312 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  45.19 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  40.19 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  39.74 
 
 
294 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  39.14 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  39.14 
 
 
294 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  39.14 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  29.11 
 
 
298 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  31.35 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.67 
 
 
303 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  29.07 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  28.43 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  28.43 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  24.84 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  29.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  28.34 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  28.03 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.94 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  30.47 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.02 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.21 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  20 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2534  hypothetical protein  23.12 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  40.35 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  40.35 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  28.12 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  28.69 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
294 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  20 
 
 
282 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
311 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  23.55 
 
 
302 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  21.98 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  26.89 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1650  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
679 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
722 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>