More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1123 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 476 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.3 
 
 		 486 aa  706    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  79.33 
 
 		 493 aa  770    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 486 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.21 
 
 		 478 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 		 484 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  69.38 
 
 		 481 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.92 
 
 		 480 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  74.06 
 
 		 495 aa  718    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  71.58 
 
 		 478 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.64 
 
 		 493 aa  771    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  69.49 
 
 		 482 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 517 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  68.14 
 
 		 477 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 490 aa  1005    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.84 
 
 		 486 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  78.75 
 
 		 493 aa  766    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 		 479 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  71.21 
 
 		 475 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 		 479 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  79.42 
 
 		 493 aa  784    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  71.01 
 
 		 477 aa  673    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  90.34 
 
 		 495 aa  909    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.68 
 
 		 485 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 		 509 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  71.19 
 
 		 472 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.25 
 
 		 485 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.45 
 
 		 491 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  71.79 
 
 		 476 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 		 486 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 		 484 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.9 
 
 		 490 aa  696    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  71.52 
 
 		 479 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  69.98 
 
 		 482 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  74.52 
 
 		 480 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  76 
 
 		 484 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 		 509 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.7 
 
 		 475 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 		 473 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.78 
 
 		 473 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.62 
 
 		 464 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.41 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.62 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 469 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.62 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  65.63 
 
 		 471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 		 465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.95 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.95 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.29 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.79 
 
 		 472 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.67 
 
 		 487 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  61.26 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  62.82 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.81 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.84 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 468 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  62.74 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  62.11 
 
 		 465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  60.66 
 
 		 482 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.86 
 
 		 482 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.05 
 
 		 467 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 		 483 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 		 483 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.64 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  62 
 
 		 470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.63 
 
 		 470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.31 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.31 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.89 
 
 		 475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.37 
 
 		 480 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.72 
 
 		 503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.6 
 
 		 468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  60.16 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.78 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  61.47 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.1 
 
 		 471 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.81 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.68 
 
 		 504 aa  572  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.93 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  58.76 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  59.75 
 
 		 485 aa  568  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.28 
 
 		 467 aa  571  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.7 
 
 		 476 aa  569  1e-161  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.41 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.57 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.67 
 
 		 476 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.71 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.63 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.07 
 
 		 465 aa  565  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.92 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>