28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1080 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1059    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  59.43 
 
 
474 aa  465  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  27.57 
 
 
461 aa  94.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  26.62 
 
 
817 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  27.7 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  27.09 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  25.82 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  28.42 
 
 
753 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  26.97 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  29 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  26.3 
 
 
427 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  28.08 
 
 
680 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  26.76 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  23.72 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  24.77 
 
 
427 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  26.49 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  28.41 
 
 
290 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  25.07 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  27.5 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  25.09 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  25.61 
 
 
404 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3124  hypothetical protein  27.65 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  23.94 
 
 
446 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  26.64 
 
 
395 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0730  hypothetical protein  20.41 
 
 
242 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000195615  normal  0.756936 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  28.82 
 
 
394 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0484  cell division protein DivIVA, putative  31.91 
 
 
256 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  24.82 
 
 
498 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>