More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0619 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  73.21 
 
 
224 aa  344  6e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  55.29 
 
 
221 aa  245  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 
217 aa  230  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  38.64 
 
 
216 aa  167  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  37.79 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  34.91 
 
 
223 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
217 aa  131  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  35.81 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
218 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 
229 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  30.77 
 
 
236 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
237 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
236 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  35.56 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  34.08 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.33 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  33.7 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  31.34 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  28.77 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  34.38 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  32.47 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  30.85 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  44.33 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  44.33 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.24 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.24 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  33.02 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  28.65 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.99 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.33 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  31.69 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.81 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.11 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  31.28 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.81 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  42.27 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  28.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  30.35 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  34.75 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  35.46 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  38.71 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  38.71 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  38.71 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
445 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.75 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.75 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.66 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 
459 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  29.85 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  30.3 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  42.27 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  29.35 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  31.98 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  28.64 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>