More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3179 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3179  DNA-binding response regulator VicR  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0255  DNA-binding response regulator  89.82 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  58.04 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  59.73 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  59.73 
 
 		 229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  59.73 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  59.73 
 
 		 229 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  58.41 
 
 		 229 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  59.29 
 
 		 229 aa  264  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  59.29 
 
 		 229 aa  264  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  59.29 
 
 		 229 aa  264  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  59.29 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.54 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0302  DNA-binding response regulator  57.52 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 256 aa  188  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.99 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.67 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.91 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.05 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.77 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.61 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.53 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  38.26 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  39.32 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  37.28 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>