More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3849 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3849  succinyl-CoA synthetase beta chain  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.19396e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.13 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.26 
 
 
386 aa  460  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.7 
 
 
386 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.26 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  96.52 
 
 
386 aa  454  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  88.26 
 
 
386 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  86.52 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.26 
 
 
388 aa  374  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.29 
 
 
388 aa  370  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.29 
 
 
388 aa  370  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.81 
 
 
384 aa  316  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  65.5 
 
 
388 aa  309  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.81 
 
 
390 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.68 
 
 
391 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.97 
 
 
392 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.14 
 
 
389 aa  291  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.68 
 
 
392 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.54 
 
 
391 aa  288  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.07 
 
 
390 aa  289  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.78 
 
 
392 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.81 
 
 
388 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.07 
 
 
389 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.81 
 
 
388 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
389 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.25 
 
 
388 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.07 
 
 
388 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.83 
 
 
403 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.94 
 
 
388 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  57.74 
 
 
399 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.19 
 
 
389 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.14 
 
 
407 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.19 
 
 
389 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.32 
 
 
388 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  56.71 
 
 
389 aa  268  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.45 
 
 
388 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.45 
 
 
388 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.45 
 
 
388 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.01 
 
 
388 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.45 
 
 
388 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.45 
 
 
388 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.02 
 
 
391 aa  264  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.14 
 
 
386 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.14 
 
 
386 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.39 
 
 
388 aa  262  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.88 
 
 
398 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.29 
 
 
388 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.29 
 
 
388 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.39 
 
 
389 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.39 
 
 
389 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.62 
 
 
392 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.39 
 
 
392 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.66 
 
 
386 aa  258  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.39 
 
 
392 aa  258  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.77 
 
 
387 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.66 
 
 
390 aa  258  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.28 
 
 
392 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  57.94 
 
 
386 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.21 
 
 
388 aa  254  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.19 
 
 
386 aa  254  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.75 
 
 
385 aa  254  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.52 
 
 
389 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.19 
 
 
386 aa  254  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.04 
 
 
389 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.08 
 
 
387 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.64 
 
 
389 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  57.21 
 
 
387 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.33 
 
 
399 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.92 
 
 
397 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.5 
 
 
397 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.5 
 
 
397 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.26 
 
 
386 aa  252  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.33 
 
 
388 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.08 
 
 
386 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.47 
 
 
407 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.06 
 
 
405 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.39 
 
 
386 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.39 
 
 
386 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.94 
 
 
395 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.75 
 
 
385 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.72 
 
 
399 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.9 
 
 
388 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.9 
 
 
388 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.1 
 
 
387 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.65 
 
 
387 aa  248  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.5 
 
 
397 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.95 
 
 
386 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  51.53 
 
 
392 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>