More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0072 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 630 aa  1301    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  64.74 
 
 		 640 aa  857    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  81.9 
 
 		 609 aa  1079    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  53.61 
 
 		 526 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  71.6 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  60.47 
 
 		 264 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4636  hypothetical protein  88.46 
 
 		 170 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  41.46 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  40 
 
 		 373 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  38.65 
 
 		 317 aa  197  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  37.54 
 
 		 431 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  36.34 
 
 		 431 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  36.73 
 
 		 431 aa  190  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  37.41 
 
 		 431 aa  190  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  37.41 
 
 		 431 aa  190  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  37.41 
 
 		 431 aa  190  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  37.41 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  35.69 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  37.41 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  38.02 
 
 		 432 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  38.02 
 
 		 432 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  37.88 
 
 		 459 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  37.26 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  35.67 
 
 		 330 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  34.67 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  36.5 
 
 		 433 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  36.5 
 
 		 433 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  35.03 
 
 		 397 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  36.5 
 
 		 433 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  38.49 
 
 		 467 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  37.74 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  35.36 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  36.46 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  35.38 
 
 		 358 aa  170  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  35.61 
 
 		 448 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 455 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 455 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  34.85 
 
 		 467 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  35.61 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  34.85 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  35.74 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  35.36 
 
 		 446 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  36.47 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  43.26 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  36.26 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  34.11 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  34.11 
 
 		 462 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  37.15 
 
 		 288 aa  164  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  34.98 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  35.23 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  34.98 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  35.09 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  35.36 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  35.23 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  34.85 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  33.69 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  34.22 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  34.6 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  37.02 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  34.47 
 
 		 443 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  34.47 
 
 		 470 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  34.47 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  33.71 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 470 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  34.09 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  34.02 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  34.36 
 
 		 472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  31.82 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.77 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  34.27 
 
 		 360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  31.44 
 
 		 360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.53 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  29.26 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  31.03 
 
 		 803 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.06 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  33.73 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.51 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.51 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1064 aa  128  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  31.1 
 
 		 460 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.45 
 
 		 592 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.83 
 
 		 478 aa  123  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  29.92 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  33.85 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.26 
 
 		 477 aa  120  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  30.97 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  31.34 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.38 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.67 
 
 		 551 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  32.44 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  31.14 
 
 		 946 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.67 
 
 		 551 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  30.54 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  30.6 
 
 		 568 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>