80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6921 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  72.44 
 
 		 127 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  67.46 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  70.87 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  70.63 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  69.84 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  69.84 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.24 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  46.72 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  46.72 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  47.01 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  45.05 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  45.05 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  44.44 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  46.61 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  43.59 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  42.37 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  44.92 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  40 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  47.27 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  39.77 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  34.21 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  36.51 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  36.76 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  35.21 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  31.96 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  35.14 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  32.67 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  40 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  32.35 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  33.8 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  32.35 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  32.23 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  33.82 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  27.88 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  32.35 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  29.87 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  29.87 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  29.87 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  28.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  31.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  33.8 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  32.35 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  32.35 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  29.87 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  30.88 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  36.92 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  32.31 
 
 		 94 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  32.79 
 
 		 100 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  23.68 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  30.12 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  33.87 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  35.29 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  35.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  35.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  34.43 
 
 		 104 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  35.82 
 
 		 104 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>