77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4814 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  100 
 
 		 964 aa  1828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  53.23 
 
 		 569 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  42.05 
 
 		 592 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  42.05 
 
 		 592 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  46.82 
 
 		 592 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  46.06 
 
 		 587 aa  303  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  46.15 
 
 		 590 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  47.16 
 
 		 585 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  46.82 
 
 		 592 aa  301  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  43.27 
 
 		 595 aa  301  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  45.85 
 
 		 604 aa  300  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  46.67 
 
 		 592 aa  300  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  46.67 
 
 		 592 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  46.67 
 
 		 592 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  46.67 
 
 		 592 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  44.87 
 
 		 589 aa  288  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  44.54 
 
 		 570 aa  281  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  38.8 
 
 		 558 aa  279  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.08 
 
 		 553 aa  258  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  43.08 
 
 		 553 aa  257  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  43.08 
 
 		 549 aa  257  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.08 
 
 		 553 aa  257  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  43.08 
 
 		 553 aa  257  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  43.08 
 
 		 553 aa  257  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  43.08 
 
 		 553 aa  257  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  42.72 
 
 		 542 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  43.21 
 
 		 559 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  43.21 
 
 		 559 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  43.21 
 
 		 559 aa  254  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  42.17 
 
 		 587 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  42.9 
 
 		 559 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  41.87 
 
 		 585 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  42.9 
 
 		 559 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  40.81 
 
 		 560 aa  238  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  41.3 
 
 		 562 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  41.46 
 
 		 568 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  43.97 
 
 		 560 aa  220  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  32.7 
 
 		 542 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  30.7 
 
 		 744 aa  144  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  31.18 
 
 		 688 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  31.18 
 
 		 688 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  28.54 
 
 		 672 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  27.75 
 
 		 644 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  28.46 
 
 		 681 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  27.53 
 
 		 693 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  27.64 
 
 		 691 aa  121  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  30.77 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  27.2 
 
 		 668 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  28.83 
 
 		 667 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  29.3 
 
 		 748 aa  109  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  25.82 
 
 		 672 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  28.34 
 
 		 679 aa  107  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  27.63 
 
 		 712 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  23.84 
 
 		 695 aa  84  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  23.63 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  23.63 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  29.05 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  28.48 
 
 		 507 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  23.91 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  30.56 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  27.5 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  26.3 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  24.14 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  23.1 
 
 		 489 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  24.64 
 
 		 519 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  26.63 
 
 		 477 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  22.77 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  23.86 
 
 		 482 aa  51.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  25.56 
 
 		 384 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  25.42 
 
 		 507 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  25.15 
 
 		 473 aa  48.9  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  21.79 
 
 		 509 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  29.19 
 
 		 524 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  22.54 
 
 		 537 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  20 
 
 		 518 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  24.85 
 
 		 459 aa  45.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  28.74 
 
 		 519 aa  45.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>