31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3587 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  100 
 
 		 1122 aa  2251    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  35.44 
 
 		 631 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.61 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  37.21 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  27 
 
 		 603 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.5 
 
 		 593 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2084  hypothetical protein  34.17 
 
 		 277 aa  69.7  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  30.16 
 
 		 660 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  26.37 
 
 		 631 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.29 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3991  hypothetical protein  29.41 
 
 		 120 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  32.84 
 
 		 438 aa  56.2  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  25.47 
 
 		 417 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.19 
 
 		 754 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  26.26 
 
 		 728 aa  50.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  26.8 
 
 		 465 aa  50.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.7 
 
 		 446 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.58 
 
 		 617 aa  49.3  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  24.57 
 
 		 302 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  24.37 
 
 		 423 aa  49.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  21.53 
 
 		 322 aa  48.9  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.73 
 
 		 397 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  23.53 
 
 		 614 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  28.7 
 
 		 442 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  23.23 
 
 		 529 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  24.28 
 
 		 672 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  30.38 
 
 		 413 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.23 
 
 		 460 aa  45.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  37.84 
 
 		 596 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  26.03 
 
 		 624 aa  45.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  25.24 
 
 		 379 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>