22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2084 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  45.54 
 
 		 578 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1956  endopeptidase La  62.5 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.340838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3560  putative ATP-dependent protease La  55.41 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.36 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1122 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.37 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  34.78 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.39 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.39 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0709  hypothetical protein  51.02 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0677  hypothetical protein  46.15 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  29.89 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.91 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0654  hypothetical protein  53.33 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41648  normal  0.346147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1127  hypothetical protein  30.47 
 
 		 146 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0661227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3298  hypothetical protein  39.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2154  hypothetical protein  48.84 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726006  normal  0.128736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  45.45 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  30 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>