19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0677 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0677  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1127  hypothetical protein  51.8 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0661227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2769  hypothetical protein  49.29 
 
 
148 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0974  hypothetical protein  51.08 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0654  hypothetical protein  49.26 
 
 
146 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41648  normal  0.346147 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2154  hypothetical protein  37.32 
 
 
144 aa  90.9  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726006  normal  0.128736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3298  hypothetical protein  33.85 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  40.43 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0709  hypothetical protein  36 
 
 
229 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  34.48 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2084  hypothetical protein  32.29 
 
 
277 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1956  endopeptidase La  47.92 
 
 
261 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.340838  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.66 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3560  putative ATP-dependent protease La  46.51 
 
 
409 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585303  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.22 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0039  hypothetical protein  40.82 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>