47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2245 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  49.19 
 
 
176 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  48.31 
 
 
175 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.44 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.37 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  42.22 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.74 
 
 
124 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1751  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.83 
 
 
122 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3096  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
120 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0517504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.3 
 
 
121 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0495016  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2420  hypothetical protein  49.14 
 
 
125 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3509  glyoxalase family protein  49.57 
 
 
125 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1523  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
130 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216178  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3863  hypothetical protein  44.35 
 
 
128 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.525519  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1171  hypothetical protein  42.06 
 
 
126 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.74 
 
 
122 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1362  hypothetical protein  40.83 
 
 
131 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.61 
 
 
119 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.34 
 
 
117 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1344  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3509  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3254  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00230166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3161  hypothetical protein  42.48 
 
 
117 aa  97.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1370  hypothetical protein  39.09 
 
 
121 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1508  hypothetical protein  39.09 
 
 
121 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1019  glyoxalase family protein  43.75 
 
 
120 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3227  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000491424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3164  hypothetical protein  41.44 
 
 
117 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.91 
 
 
135 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
126 aa  87.8  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.64 
 
 
119 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5790  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.59 
 
 
120 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3048  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.94 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.05 
 
 
123 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.054762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.05 
 
 
123 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2769  hypothetical protein  61.36 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0654  hypothetical protein  55.56 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41648  normal  0.346147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1127  hypothetical protein  44.62 
 
 
146 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0661227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0677  hypothetical protein  57.78 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3298  hypothetical protein  45.45 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0974  hypothetical protein  48.98 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1430  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
121 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363294  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1956  endopeptidase La  38.89 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.340838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3560  putative ATP-dependent protease La  42.11 
 
 
409 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
136 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>