14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2769 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2769  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0654  hypothetical protein  59.85 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41648  normal  0.346147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1127  hypothetical protein  51.75 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0661227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0677  hypothetical protein  49.29 
 
 		 181 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0974  hypothetical protein  51.75 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2154  hypothetical protein  39.01 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726006  normal  0.128736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3298  hypothetical protein  37.3 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  51.11 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.54 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  42.62 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  47.62 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.98 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3560  putative ATP-dependent protease La  46.34 
 
 		 409 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0039  hypothetical protein  41.3 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>