11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2154 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2154  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  292  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726006  normal  0.128736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1127  hypothetical protein  45.89 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0661227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0974  hypothetical protein  44.9 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0654  hypothetical protein  43.97 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41648  normal  0.346147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2769  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0677  hypothetical protein  37.32 
 
 		 181 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3298  hypothetical protein  37.78 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  39.47 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  40.62 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2084  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.08 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>