More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1956 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1956  endopeptidase La  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.340838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3560  putative ATP-dependent protease La  51.15 
 
 		 409 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 799 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 805 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  39.9 
 
 		 799 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  40.51 
 
 		 802 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  40.51 
 
 		 802 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 		 802 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.58 
 
 		 818 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  36.41 
 
 		 801 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 		 802 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 		 802 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  38.61 
 
 		 816 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  36.27 
 
 		 782 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  37.69 
 
 		 867 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  37.24 
 
 		 798 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.72 
 
 		 799 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  37.24 
 
 		 798 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  37.82 
 
 		 809 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  39.09 
 
 		 798 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  36.92 
 
 		 797 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  38.34 
 
 		 807 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  34.38 
 
 		 785 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  37.69 
 
 		 798 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  37.24 
 
 		 798 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  36.18 
 
 		 806 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  36.18 
 
 		 806 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  38.69 
 
 		 805 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  37.68 
 
 		 806 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  37.68 
 
 		 806 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  36.18 
 
 		 807 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  39.3 
 
 		 810 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 		 784 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  34.36 
 
 		 785 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  36.45 
 
 		 805 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  36.18 
 
 		 806 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  34.36 
 
 		 785 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.2 
 
 		 784 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  35.64 
 
 		 816 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  33.17 
 
 		 785 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  35.57 
 
 		 816 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  33.17 
 
 		 781 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 785 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  38.27 
 
 		 823 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 785 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  34.36 
 
 		 785 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  34.36 
 
 		 785 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  36.41 
 
 		 798 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  35.94 
 
 		 811 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 785 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  32.82 
 
 		 785 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  38.92 
 
 		 805 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  35.57 
 
 		 806 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  34.87 
 
 		 787 aa  131  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  35.57 
 
 		 816 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 808 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  36.68 
 
 		 808 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 837 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  35.68 
 
 		 804 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  35.68 
 
 		 804 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  35.75 
 
 		 810 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  36.92 
 
 		 798 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  36.18 
 
 		 824 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.18 
 
 		 784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 823 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.18 
 
 		 784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  32.82 
 
 		 785 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 		 812 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 		 812 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.18 
 
 		 784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  36.68 
 
 		 807 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  36.5 
 
 		 804 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 787 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.18 
 
 		 793 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.87 
 
 		 786 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  34.15 
 
 		 807 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.73 
 
 		 812 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 820 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  35.18 
 
 		 803 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  34.98 
 
 		 823 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  38.31 
 
 		 810 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 802 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  36.98 
 
 		 812 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  32.82 
 
 		 785 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 810 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 793 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>