More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0607 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 456 aa  941    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 457 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 459 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  51.1 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.23 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 508 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 485 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 479 aa  243  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 512 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 881 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 469 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 468 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 492 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 462 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 469 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 475 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 472 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1690  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 490 aa  229  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  31.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>