More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0383 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 338 aa  699    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  66.77 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  65.56 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  66.25 
 
 		 328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  63.41 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  63.42 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  62.13 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  62.43 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  62.43 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  57.93 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  57.8 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  57.32 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  57.01 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  57.32 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  57.01 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  56.71 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  56.1 
 
 		 336 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  56.13 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  56.18 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  55.49 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  57.31 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  53.27 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  52.38 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  52.98 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  53.27 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  54.05 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  52.65 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  48.8 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  46.93 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  46.29 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  48.8 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  47.92 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  44.41 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  45.62 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  48.26 
 
 		 335 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  48.73 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  48.28 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  43.77 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  43.47 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  43.93 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  44.82 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  42.63 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  41.85 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  43.52 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  41.98 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  42.9 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  41.14 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  45.25 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  42.99 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  42.28 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  41.56 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  41.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  41.8 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  40.81 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  42.28 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  40.81 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  40.81 
 
 		 322 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  42.24 
 
 		 323 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  41.12 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  42.59 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  41.12 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  41.12 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  40.8 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  42.55 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  42.59 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  41.05 
 
 		 323 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  41 
 
 		 322 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  41.23 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  40.37 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  41.1 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  46.1 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  42.19 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  41 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.9 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  40.68 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  43.09 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>