153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  100 
 
 
441 aa  909    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  68.82 
 
 
437 aa  634    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  64.32 
 
 
468 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  63.25 
 
 
468 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  64.77 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  63.95 
 
 
449 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  59.35 
 
 
438 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  58.06 
 
 
474 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  59.22 
 
 
438 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  57.53 
 
 
453 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  57.56 
 
 
457 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  57.47 
 
 
456 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  57.01 
 
 
456 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  55.73 
 
 
451 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  55.73 
 
 
451 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  55.73 
 
 
451 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  55.73 
 
 
451 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  55.51 
 
 
451 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  55.51 
 
 
451 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  55.51 
 
 
451 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  55.51 
 
 
451 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  54.61 
 
 
451 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  54.38 
 
 
451 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  54.61 
 
 
451 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  54.61 
 
 
451 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  54.38 
 
 
451 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  56.12 
 
 
432 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  54.65 
 
 
446 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  53.55 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  51.38 
 
 
435 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
440 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  50.56 
 
 
441 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  52.42 
 
 
439 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  48.98 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  48.96 
 
 
430 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  49.31 
 
 
430 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  47.52 
 
 
435 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  45.19 
 
 
441 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  43.5 
 
 
441 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  45.14 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  43.08 
 
 
439 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  43.87 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  43.94 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  37.67 
 
 
489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  36.92 
 
 
447 aa  266  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
490 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  36.61 
 
 
488 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  36.16 
 
 
488 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  35.48 
 
 
490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 
426 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  35.32 
 
 
426 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 
453 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  26.57 
 
 
452 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  29.87 
 
 
463 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  30.7 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  29.17 
 
 
476 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  28.44 
 
 
447 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
466 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  26.77 
 
 
460 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  27.25 
 
 
474 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 
452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  27.29 
 
 
485 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  27.56 
 
 
441 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.76 
 
 
432 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
441 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  27.56 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  25.38 
 
 
436 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  27.13 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  28.1 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  28.1 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  27.15 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 
440 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.89 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.89 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.45 
 
 
440 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
436 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
435 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  24.53 
 
 
468 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.14 
 
 
440 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.36 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  23.84 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 
440 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  28.57 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.38 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
424 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  26.88 
 
 
442 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  25.69 
 
 
463 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  25.28 
 
 
416 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>