35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  80.54 
 
 
275 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  80.54 
 
 
275 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  80.16 
 
 
252 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  80.95 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  65.08 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  46.88 
 
 
275 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  47.6 
 
 
245 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  42.06 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  40.87 
 
 
248 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  44.44 
 
 
245 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  42.06 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  40.48 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  41.22 
 
 
238 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  40.54 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  36.68 
 
 
241 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  31.98 
 
 
243 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  32.31 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  31.73 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  31.72 
 
 
276 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  31.98 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  28.95 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  32.71 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  31.9 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  32 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  29.91 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  32.73 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  31.06 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  29.72 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  31.34 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  25.32 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  26.11 
 
 
262 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  25.66 
 
 
262 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  41.82 
 
 
99 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>