101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
146 aa  287  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.39 
 
 
139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.92 
 
 
151 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.62 
 
 
153 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.44 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.62 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.11 
 
 
146 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.11 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 
139 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.85 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.91 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.37 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.12 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  36.27 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.23 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.78 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  23.81 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  23.26 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.37 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.6 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.01 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2451  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2161  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.05 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  22.48 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.05 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.05 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1523  ATP synthase F1, epsilon subunit  25.98 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000221531  unclonable  1.83775e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0129  ATP synthase F1, epsilon subunit  30 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  28.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.19 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.67 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2329  hypothetical protein  25.47 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.15 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.5 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.36 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  24.8 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.19 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.41 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.81 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.64 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.64 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.64 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.17 
 
 
142 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.28 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.99 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.25 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.93 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.72 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.66 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
135 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.07 
 
 
125 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>