33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2793 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.36 
 
 		 151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  67.91 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.3 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.93 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.62 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.2 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  33.94 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.61 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2329  hypothetical protein  29.09 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.51 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.51 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.04 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.38 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>